Установление первичной структуры пептидов
Первичная структура пептидов и белков определяется путем последовательного отщепления α-аминокислот с какого-либо конца макромолекулярной цепи и их идентификации.
В настоящее время разработано много методов определения аминокислотной последовательности. Остановимся на некоторых из них :
1) Метод Сенгера - один из первых методов с 2,4-динитрофторбензолом (ДНФБ)
2) Метод Эдмана с фенилизотиоцианатом (ФТГ)
Преимуществом этого метода является то, что при отщеплении каждой N-концевой α-аминокислоты, остальная часть пептидной молекулы не разрушается. Такие же операции можно повторять дальше до полного определения первичной структуры и этот метод получил название деградации по Эдману (1950 год)
Метод Эдмана лежит в основе автоматического прибора - секвенатора (sequence от английского - последовательность). Полученное на каждой стадии производное идентифицируется либо ГЖХ либо ТСХ или жидкостной хроматографией.