Фотореактивация
Типы и механизмы репарации.
Ферменты репарации
Эндонуклеазы – расщепляют связи внутри ДНК.
Экзонуклеазы – расщепляют связи с концов, могут быть специфичными для 5‘ и 3‘ концов ДНК.
ДНК-полимеразы – заполняют брешь, используя комплементарнуюцепь в виде матрицы.
Лигаза – катализирует образование фосфорнодиэфирных связей, используя энергию гидролиза АТФ.
ДНК-гликозилаза – расщепляет N-гликозидную связь.
АР-эндонуклеза – разрезает ДНК в апуриновых или апиримидиновых участках с образованием 5‘ конца
Прямая репарация ДНК
Прямое восстановление исходной структуры ДНК или удаление повреждения (структура поврежденного нуклеотида восстанавливается без его вырезания)
n Фотореактивация пиримидиновых димеров;
n репарацию ДНК за счет 3’-5’-экзонуклеазной активности ДНК-полимеразы;
n репарацию одноцепочечных разрывов ДНК с помощью полинуклеотидлигазы;
n генетическую репарацию повреждений, вызванных алкильными или метильными группами, путем удаления этих групп специфическими ферментами. Метилтрансферазнаяактивность(гликозилаз удаляют метильные группы)
Эксцизионная репарация
Репарация с удалением поврежденных
оснований
- удаление одного нуклеотида
- удаление фрагмента ДНК
n мисмэтч репарация
Индуцируемая репарация
SOS-репарация
Рекомбинативная репарация
– прямая репарация,происходит у бактерий на свету при участии специального фермента – фотолиазы,
Этапы:
1. Активация фотолиазы под действием света (путем дестабилизации ее электронов)
2. Перенос электронов в пиримидиновый цикл и ослабление связи с пентозой
3. Освобождение азотистого основания и замена на новое
Репарация путем удаления нуклеотидов - (NER)
восстановление достаточно длинных фрагментов ДНК.
Этапы:
· Белковый комплекс (XPA-PRA) распознает дефектный участок;
· Нуклеаза производит разрыв на расстоянии 5 пнот 3’ конца и 8 пн от 5’конца;
· Образованная брешь заполняется при помощи ДНК-полимераз δ и ε;
ДНК-лигаза сшивает концы.