Запретить монахам странничать.
Принять меры против строителей новых монастырей, делавших сие не для Бога, а для обмана людей и для своего чрева. «Старец на лесу келью поставит или церковь срубит, да пойдет по миру с иконою просити на сооружение, а у меня земли и руги (корма) просит, а что собрав то пропьет. А в пустыни не по Бозе совершает. Герберштейн: «Мы видели, как в Москве пьяных священников всенародно подвергали бичеванию, при этом они жаловались только на то, что их бьют рабы, а не бояре».«Несколько лет назад один наместник государев велел повесить священника, уличенного в краже. Митрополит пришел в негодование и доложил государю. А наместник ответил, что он повесил вора, а не священника. И наместника не наказали».
Относительно жизни мирян. Собор преследовал во-первых судебное целование креста на лживе и содомский блуд. Против безнравственных обычаев: стрижение бороды, имевшее безнравственную цель — содомский грех. Запрещал собор совместное мытье в банях: «Да во Пскове граде моются в банях мужи и жены, и чернцы и черницы в одном месте без зазору». Против употребления в пищу крови убитых животных, ядения удавленины, против игры в зернь (современные карты), против татаромании в одеже, т.е. ношения на голове тафьи (татарский обычай): «Миряне входили и стояли в церквах в шапках словно на пиру или корчемнице. Говор, ропот, всякие прекословия и срамные слова, песни божественные не слушают…» Против народных языческих увеселений, против волхования, против скоморохов, против скитавшихся по миру пройдох.
11 мая собор завершил работу, насколь в действительности совершилось обновление церкви. Голубинский восклицает: «Увы грустный ответ на вопрос есть тот, что обновление не совершилось почти нисколько». «И деяния собора превратились в простой литературный памятник.», «После Макария нужен был ряд таких же Макариев». По окончании Стоглавогособора царь с епископами постановил «соборный приговор» об архиерейских и монастырских вотчинах.
1. В будущим монастырям и архиереям вотчин без доклада царю не покупать.
2. Возвратить прежним владельцам вотчины, которыми монастыри завладели за долги.
3. Вернуть боярам села, волости, рыбные ловли, данные архиереям и монастырям после смерти Василия III(1533 г.).
Вот так Иван Грозный ограничивает монастырское землевладение. На большее царь не дерзнул, ибо митрополит принадлежал к защитникам церковного землевладения. Некоторые историки пишут: «Непонятным казусом деяний собора является узаконения обязательности двоеперстия и сугубой пения аллилуйи, запрет стрижки бороды и усов». Наверное в этом смысле выссказался Флоровский: «Стоглав был задуман как реформационный собор, а осуществлялся как реакционный» (защищал старину).