Репарация по ходу репликации

ІІ. Репликационная система репарации

ААТТА---------------АЦТАТААТТ ААТТАА--------------ЦТАТААТТ

ТТААТТГАТ----------------АТТАА ТТААТТ--------------ГАТАТТАА

Рестрикция ДНК с образованием Рестрикция ДНК с образованием

«липких концов» «тупых» концов»

Рис. 4.2. Схема гидролиза ДНК рестриктазами с образованием

«липких» и «тупых» концов

Типы рестриктаз

Рестриктазы І типа: рестриктазы ЕсоВ и ЕсоК имеюттри субъединицы:

S-субъединица распознает сайт рестрикции;

М-субъединица – фермент метилаза;

R-субъединица – рестриктаза.

Донором СН₃-групп для метилирования является S-аденозилметионин. Сайтами узнавания для рестриктаз первого типа служат двусторонние и ассиметричные последовательности ДНК.

Рестриктазы ІІ типа (ЕсоRI, Bst I, Hind III, Alu I, Pst I и др.) – осуществляют только рестрикцию, метилирование производит другой фермент. Рестриктазы ІІ типа разрезают ДНК в неметилированных палиндромных сайтах (центральная симметрия с образованием тупых или липких концов).Эти ферменты очень специфичны, используются для рестрикционного анализа ДНК, а также в генной инженерии. EcoRI имеет две идентичных субъединицы. Сайты узнавания и рестрикции совпадают.

Рестриктазы ІІІ типа ‑ это рестриктазы промежуточного типа. В состав фермента входит и рестриктаза и метилаза, сайт узнавания находится неподалеку от сайта рестрикции.

Впервые рестриктазы были обнаружены у прокариот. У эукариот метилирование также происходит, но без рестрикции. Оно обеспечивает различное функциональное состояние генов. Защита от вирусов у эукариот осуществляется другим способом.

Репликационная система репарации функционирует для проверки правильности репликации. У прокариот ее осуществляют ДНК-полимераза I и ДНК-полимераза III прямо по ходу репликации, т.к. указанные ДНК-полимеразы присоединяют следующий нуклеотид только к спаренному с матрицей предыдущему нуклеотиду.