Этапы развития микробиологии


· Эвристический ― Дж. Фракасторо

· Описательный (микрографический) ― А. Левенгук

· Физиологический ― Л. Пастер, Р. Кох

· Иммунологический ― И.И. Мечников, П. Эрлих

· Вирусологический ― Д.И. Ивановский

· Современный (молекулярно-генетический)

1. Эвристический период (до изобретения микроскопов и их применения для изучения микромира). Размеры микроорганизмов лежат за пределами разрешающей способности человеческого глаза, поэтому до изобретения микроскопа человек не знал об их существовании. Однако люди на протяжении тысячелетий научились широко использовать в своих целях процессы жизнедеятельности многих микробов, в частности, для приготовления молочнокислых продуктов, получения вина, уксуса, пива, силосования кормов. В течение многих веков природа процессов брожения оставалась неясной. Наряду с этим человек давно познал и другую сторону жизнедеятельности микроорганизмов: их способность вызывать повальные заразные болезни, от которых погибало множество людей. Происхождение и причины таких болезней также тысячелетиями были непонятны.

О природе заразных болезней высказывались различные предположения, в том числе и такое, что их возбудителями являются какие-то мельчайшие живые существа ― контагии. В наиболее законченной форме эта идея была сформулирована в XVI в. выдающимся итальянским ученым, поэтом и врачом Джироламо Фракасторо. Он четко сформулировал положение, что зараза — это материальное начало («контагий телесен»). В своем главном медицинском труде «О контагии, контагиозных болезнях и лечении» (1546 г.) он предположил живую природу агентов инфекционных заболеваний ― contagium vivum.

2. Описательный (микрографический) период занял около двухсот лет.

Антони ван Левенгук в 1675 г. впервые описал простейших, в 1683г. ― основные формы бактерий.

3. Физиологический период (с 1875 г.) ― эпоха Луи Пастера и Роберта Коха.

Открытия Л. Пастера:

· Промышленная микробиология (брожение).

· Разработка принципов асептики и методов стерилизации.

· Открытие возбудителей инфекционных заболеваний: сибирской язвы, родильной горячки, нагноений.

· Профилактика инфекционных заболеваний ― разработка вакцин против куриной холеры, сибирской язвы, бешенства.

Открытия Р. Коха:

· Методологические основы изучения микроорганизмов ― триада Генле-Коха.

· Усовершенствование микробиологических методов исследования.

· Открытие возбудителей холеры (1882), туберкулеза (1883).

4. Иммунологический период. И.И.Мечников создал новую эпоху в микробиологии ― учение о невосприимчивости (иммунитете), разработав теорию фагоцитоза и обосновав клеточную теорию иммунитета.

Открытия И.И. Мечникова:

· Фагоцитарная теория иммунитета (лауреат Нобелевской премии, 1908).

· Учение об антибиозе.

· Основы геронтологии.

Одновременно с развитием клеточной теорию иммунитета накапливались данные о выработке в организме антител против бактерий и их токсинов, позволившие П.Эрлиху разработать гуморальную теорию иммунитета. В последующей многолетней и плодотворной дискуссии между сторонниками фагоцитарной и гуморальной теорий были раскрыты многие механизмы иммунитета и родилась наука иммунология.

5. Вирусологический период. 12 февраля 1892 г. на заседании Российской академии наук Д.И. Ивановский сообщил, что возбудителем мозаичной болезни табака является фильтрующийся вирус. Эту дату можно считать днем рождения вирусологии, а Д.И. Ивановского ― ее основоположником. Впоследствии оказалось, что вирусы вызывают заболевания не только растений, но и человека, животных и даже бактерий.

Вирусология ― наука, изучающая морфологию, физиологию, генетику, экологию и эволюцию вирусов, эпидемиологию, методы лабораторной диагностики, специфической профилактики и лечения вызываемых ими заболеваний.

6. Современный (молекулярно-биологический) период (со 2-й половины XX в.).

Основные достижения:

· расшифровка молекулярной структуры и молекулярно-биологической организации большинства бактерий и вирусов;

· открытие новых форм жизни (инфекционных белков ― прионов и инфекционных РНК ― вироидов);

· разработка методов культивирования животных и растительных клеток;

· разработка принципиально новых способов диагностики инфекционных и неинфекционных заболеваний (ИФА, РИА, иммуноблотинг, гибридизация НК, ПЦР);

· открытие новых возбудителей вирусных и бактериальных инфекций (ВИЧ, возбудители геморрагических лихорадок, легионелл и др.);

· создание принципиально новых вакцин и других лечебных, профилактических и диагностических препаратов.

Систематика, номенклатура, классификация микроорганизмов

Систематика занимается всесторонним описанием видов организмов, выяснением степени родственных отношений между ними и объединением их в различные по уровню родства классификационные единицы (таксоны).

Классификация — составная часть систематики. Занимается распределением организмов в соответствии с их общими признаками по различным таксонам.

Таксономия — наука о принципах и методах распределения (классификации) организмов в иерархическом плане.

Таксономические категории

Высшие таксоны Низшие таксоны
· царство · отдел · класс · порядок · семейство · род · вид · морфовар · хемовар · биовар · патовар · серовар · фаговар

Основной таксономической единицей в биологии является вид (species).

Вид – это эволюционно сложившаяся совокупность микроорганизмов, имеющих единое происхождение, сходный генотип и максимально близкие фенотипические признаки и свойства.

Принципы систематики

· Филогенетический (для крупных таксонов).

· Фенотипический. В нем используются:

à тинкториальные свойства — способность окрашиваться различными красителями;

à культуральные свойства — особенности роста бактерий на жидких и плотных питательных средах;

à подвижность;

à спорообразование — форма и характер расположения споры в клетке;

à физиологические свойства — тип питания, тип дыхания;

à биохимические свойства — способность ферментировать различные субстраты;

à антигенные свойства.

· Генотипический. Для классификации бактерий, помимо изучения их фенотипических свойств, все более широко используют методы геносистематики. В ее основе лежит изучение нуклеотидного состава ДНК и наиболее важных характеристик генома, в частности, его размера (величина, объем, молекулярная масса) и других параметров. Наиболее точным методом установления генетического (геномного) родства между бактериями является определение степени гомологии ДНК. Чем больше идентичных генов, тем выше степень гомологии ДНК и ближе генетическое родство.

· Смешанный (нумерический). В основе нумерической таксономии лежит принцип сопоставления организмов по возможно большему количеству учитываемых признаков при допущении, что все они для систематики равноценны. Однако принцип равнозначности является основным недостатком этого метода.

Идентификация ― установление таксономического положения микроорганизмов и прежде всего их видовой принадлежности. Определение видовой принадлежности является решающим моментом бактериологической диагностики инфекционных заболеваний. Чаще всего для идентификации патогенных бактерий изучают их морфологические, тинкториальные, культуральные, биохимические и антигенные свойства.

Современная классификация бактерий

«Определитель бактерий-9» (Bergey's Manual of Determinative Bacteriology-9) вышел в свет в 1993г. Согласно определителю Берги царство Procaryotae разделено на отделы, отличающиеся друг от друга строением клеточной стенки и отношением к окраске по способу Грама.

В составе 4-х отделов главных категорий прокариот выделяют:

· Отдел I. (Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку, или Gracilicutes).

· Отдел II. (Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку, или Firmicutes).

· Отдел III. (Эубактерии, лишенные клеточной стенки, или Tenericutes).

· Отдел IV. (Архебактерии, или Mendosicutes).

Отделы определителя Берги, в свою очередь, подразделяются на группы. Грацилокуты включают 1-16-ю группы, фирмикуты ― 17-29-ю, тенерикуты представлены одной 30-й, мендозикуты ― 31-39-й группами.

В составе групп выделено более 200 родов прокариот, распределенных по семействам и подгруппам.

В «Определителе» детальному описанию видов предшествует обобщенная характеристика трех наиболее ярких признаков, используемых для их идентификации:

1) отношение к кислороду;

2) отношение к источникам энергии и питательных веществ;

3) особенности морфологии.

Для обозначения видов бактерий используют бинарную номенклатуру, состоящую из названия рода (пишется с заглавной буквы) и вида (пишется всегда со строчной буквы и состоит из одного слова), например, Neisseria meningitidis (возбудитель эпидемического цереброспинального менингита — род Neisseria, вид meningitidis). Когда название вида неоднократно повторяется, то первый раз название рода пишется полностью, а затем пишется только его начальная буква. Например, Neisseria meningitidis N. meningitidis.

В микробиологии широко применяются специальные термины: штамм, чистая культура, клон.

Штаммом называют культуру, выделенную из определенного источника, или из одного и того же источника в разное время. Штаммы обозначают либо протокольными номерами, либо по источнику выделения (человек, животное, внешняя среда), либо по местности (городу), где он был выделен. Штамм — более узкое понятие, чем вид. Штаммы одного и того же вида могут быть идентичными или различаться по некоторым признакам, не выходящим за пределы вида.

Чистая культура представляет собой микробные особи одного и того же вида, полученные из одной изолированной колонии, выращенной на плотной питательной среде.

Клономназывают культуру микроорганизма, выделенную из одной клетки (одноклеточная культура).